脑膜炎球菌是革兰阴性菌，脑膜炎球菌的学名是脑膜炎奈瑟氏球菌，为流行性脑脊髓膜炎的病原菌。革兰氏阴性双球菌，在急性期或早期脑脊髓液中，大多位于中性粒细胞内，呈肾形成双排列，凹面相对。电镜下可以观察到自病人分离的毒性菌株有微荚膜和菌毛。