做胃镜检查本身不会对身体造成伤害，但是如果操作不当，也会引起胃出血、胃黏膜撕裂、胃穿孔等后果。
做胃镜操作的过程中有可能会出现恶心想吐、异物感、堵塞感、腹胀等症状，不过这些症状，往往在做胃镜检查之后的一天左右就会消失。而且现在临床上有无痛的胃镜，如果担心会出现这些不适症状，患者也可以选择做无痛胃镜。