吃头孢菌素类的药物有可能引起腹泻。头孢菌素类药物的不良反应中比较常见的就是胃肠道的不适症状，例如恶心、呕吐、上腹饱胀、食欲不振，甚至腹痛、腹泻等。
患者需要注意的是，长期或大剂量应用头孢菌素对于体质差的群体会杀死一部分正常的肠道细菌，导致肠道细菌菌群失调，从而引发腹泻。所以应在医生指导下使用头孢菌素，如果使用头孢后腹泻可以选用整肠生类药物就会缓解腹泻症状。