吃了酵素肚子疼，患者可以通过使用药物、饮食调理来处理。具体内容如下：
对于便秘的人来说，酶是比较好的选择。酶能够促进肠胃的蠕动，促进消化道中的宿便排出，所以肠胃不好的人在服用酶后会促进肠胃的蠕动，导致腹痛、拉肚子的情况。如果出现了腹泻、腹痛的情况，可以选择使用蒙脱石散、黄连素等药物进行治疗，还可以调整饮食，注意饮食清淡，多喝热水。