通常来说，纤维胃镜检查会有一定的痛苦感。
在做纤维胃镜时会有一些疼痛，这个测试要求将透镜用一根管子放进肚子里，然后用软管里的纤维将它传送到外面。最大的疼痛是气管在经过喉咙后会对咽部造成刺|激，引起恶心、呕吐等症状，通常情况下咽部疼痛会减轻一些。此外，在做检查的过程中，还要往胃里灌入一些气体，这样可以观察到胃壁有没有损伤，会出现腹痛等情况。