通常来说，消化道紊乱可以通过使用药物、一般治疗等进行处理。
消化道功能失调如果不考虑到有器质性的疾病，那么就需要考虑到心理上的问题，例如精神压力过大、焦虑、忧虑等，这些都会导致胃肠功能的正常运转，从而导致胃肠道的机能出现问题。可以口服谷维素、消化酶、维生素B1、吗丁啉等药物，还可以口服具有镇静安眠、解痉止痛等作用的药物。同时建议进行膳食调理，避免食用辛辣刺激的食物。