通常情况下，跑步时肚子痛的患者应注意按照医嘱通过日常护理、使用药物等方式进行治疗。具体情况分析如下：
日常护理：跑步时肚子痛的患者应该停止跑步、坐下来、深呼吸、多休息有利于缓解症状。
使用药物：患者如果跑步时肚子痛，可以按照医嘱使用一些止疼的药物进行治疗，比如布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片、复方阿司匹林片等。