一般情况下，谷氨酰转移酶升高的话，表示肝细胞有损害，肝功能受到影响了。内科疾病有脂肪肝、酒精肝、肝硬化以及心肌疾病、肾脏疾病、免疫系统疾病，这些疾病都可以造成肝脏内源性的问题，导致谷酰转肽酶升高。
当然也有一些外科疾病，包括胆道梗阻、胆道结石，胆道肿瘤、肝脏占位性病变，以及一些肿瘤的晚期，都能够造成谷氨酰转移酶的偏高。