拉肚子菌群失调可以通过手术治疗、日常护理、药物治疗等方式进行治疗，具体分析如下：
1、饮食要平衡，要有充足的营养，在日常生活中要多吃富含纤维素的食物，保持肠道的菌群平衡。
2、多吃富含益生元的食物，益生元是一种含有低聚果糖、低聚异麦芽糖、大豆低聚糖等可溶性膳食纤维。
3、可以多吃一些益生菌，比如每天多喝一些含有益生菌的酸奶。还可以服用含有酪酸梭菌活菌片、双歧杆菌等益生菌的药物。