磁共振只能确定脑的形态，不能确定具体的病情，因此腰穿也是需要的，只有腰穿才能确定疾病的性质。
脑炎是儿童中枢神经系统的一种常见传染病。腰椎穿刺用针从脊髓中取出少量的脑积水。一般来说，没有后遗症，但属于侵入性检查。脑炎有细菌性脑炎、病毒性脑炎以及结核性脑炎等类型。除了做穿刺同时还要检查脑脊液生化，进而来明确是病毒或者是细菌感染。