跑步时出现右侧腹痛的原因，可能是剧烈运动，腹腔内脏器运动不协调，容易出现梗阻，如肠套叠，回肠末端套入盲肠，表现为右侧下腹部疼痛、腹肌紧张、压痛反跳痛。可通过腹部CT检查明确诊断，一般需要手术治疗。还可能是右侧卵巢，输卵管疾病，是由于剧烈运动引起附件扭转，导致疼痛。不排除岔气的影响，建议及时就医明确病因，对症进行治疗。