无痛胃镜和普通胃镜都有一定的风险，但是无痛胃镜的风险相对更高。
无痛胃镜和普通胃镜都是一种侵犯性的检查，是一种有创的检测方法，都存在一定的风险。无痛胃镜疼痛感较轻，也不会引起咽部对抗反，但是无痛胃镜的病人，可能会因为芬太尼和异泊酚的作用而陷入深度睡眠迷，出现抑制呼吸的现象，在检测的时候，会发生误吸和坠积性的肺炎。因此，无痛胃镜的风险相对更高。