肚子有水声咕噜咕噜响可能是胃肠功能紊乱、肠道易激综合症等原因引起的。
1.胃肠功能紊乱：胃肠功能紊乱又称胃肠神经官能症，在排除器质性病变前提下，精神因素为本病发生的主要诱因，如情绪紧张、焦虑、生活与工作上的困难、烦恼、意外不幸等，发病时可能会有肚子有水声咕噜咕噜响的症状。
2.肠道易激综合症：是一组持续或间歇发作，以腹痛、腹胀、排便习惯和（或）大便性状改变为临床表现，而缺乏胃肠道结构和生化异常的肠道功能紊乱性疾病，发病时可能会有肚子有水声咕噜咕噜响的症状。