缺少消化酶会导致食物的不完全分解，然后集中在结肠，容易造成消化不良、变性疾病、和快速老化的环境。所以需要及时治疗。
患有胰腺功能不全和囊性纤维化的人常需要补充胰酶（包括蛋白水解酶、脂肪酶和淀粉酶）。另外，那些患有肠道疾病或消化不良的人会缺乏消化酶。还有类似便秘型人群、慢性肠胃炎人群、睡眠不足人群、消化功能减退的中老年人群、长期饮酒人群等都是缺乏身体中缺乏消化酶的主要人群。建议患者遵医嘱服用双歧杆菌、乳酸菌等药物来调节肠道菌群，从而缓解缺少消化酶的现象。