吃了治疗幽门螺旋杆菌的药，胃不舒服的原因如下：
奥美拉唑、克拉霉素、阿莫西林等治疗幽门螺旋杆菌的药物可能会刺激胃黏膜，容易引起恶心、呕吐、胃部烧灼感、食欲不振等症状，这是正常的，不用过分紧张和担心。必要时，患者可在医生的指导下服用健胃消食片等药物来缓解症状。
日常生活中，建议患者每天三餐要规律，少食多餐，以易吸收的食物为主，还要保持健康的作息。