十二指肠球炎患者在医生指导下，口服消炎类的药物，也可以口服一些H2受体拮抗剂、质子泵抑制剂等，来帮助十二指肠球炎的康复。如果是由幽门螺杆菌引起的，那么可以在医生指导下使用奥美拉唑、克拉霉素等联合治疗，同时还可以在医生指导下使用一些抑制胃酸的药物。
此外，患者不要吃辛辣刺激的食品，以免加重症状，进而不利于疾病恢复。