由于无痛肠镜会应用麻醉剂，有些病人会出现方向性功能障碍，所以24个小时内不能开车，不能从事机械操作、高空作业、商务谈判等活动。一些病人在做完肠镜后会出现腹痛、腹胀等症状，可以通过轻柔的按摩来帮助排便、排气。在做完无痛肠镜后，可以在病房外面歇上一段时间，并请家人陪伴。
此外，患者应该避免食用辛辣、刺激的食物，以免影响机体恢复。