半夜肚子疼醒可通过药物、日常调理等方式进行治疗，具体如下：
半夜肚子疼醒可能是受凉、消化不良等原因。一般可使用吗丁啉、多潘立酮等药物进行治疗。如果患者症状严重，建议及时就医。
在治疗期间，患者应避免剧烈运动，饮食应以高蛋白、低脂肪、无刺激、易消化的食物为主，少食多餐，避免饮食过多、过快、过饱，避免刺激性饮食。