一般情况下，治疗消化不良的药物有铝碳酸镁片、胰酶肠溶片、多潘立酮、莫沙必利、奥美拉唑等，服用这些药物需在医生的指导下进行。
药物的选择和使用均需在医生指导下进行，不可自行服药。患者应予以系统正规的治疗。治疗期间患者要注意饮食清淡，放松心情，每天坚持适量运动，比如游泳散步、瑜伽等，有助于患者的病情恢复。