治疗便秘效果较好的药物有开塞露、乳果糖、复方聚乙二醇电解质散、麦麸、硫酸镁、番泻叶等，中药有便通胶囊、芪蓉润肠口服液、复方芦荟胶囊、麻仁润肠丸等。具体用药需要在医生的指导下，根据便秘的原因选择适合的药物。
要从小剂量开始，可以少量单次的应用，绝对不能大量长期的使用，会造成严重的腹泻，菌群失调副作用。