生气时小腹部疼痛的原因有消化不良或肠内应激综合症等，具体如下：
如果愤怒导致精神压力，造成小腹的血管收缩，容易出现生气时小腹部疼痛；如果曾经有过消化不良或肠内应激综合症，那么在愤怒过后可能会加剧症状，从而导致小腹疼痛；患有前列腺肥大或前列腺炎的人，在愤怒的情绪下会导致腹痛。
在日常生活中，患者需要养成良好习惯，少吃油腻、辛辣食物，否则容易给身体造成不良影响。