胆源性消化不良可以通过药物、物理治疗等方法进行治疗。肝组织损伤是引起这种疾病的主要原因，可以通过服用保肝利胆类药物来改善肝系统的功能，从而减轻胆汁分泌不足的情况，还原型谷胱甘肽、多烯磷脂酰胆碱等。此外，如果出现食欲减退、营养不良、腹部闷胀等疾病，还可以配合一些营养药剂、助消化药、促进肠胃动力的药物，比如复合维生素片、消化酶片、西沙必利胶囊等。良好的生活习惯和合理的膳食可以防止疾病的恶化。