女性小便时肚子疼需要明确一下疼痛的具体部位，持续的时间，诱发和缓解的因素，是否有尿频，尿急，尿血，发烧，白带异常等情况。而临床上导致这种情况的病因，常见的有泌尿系感染，结石，结核、肿瘤以及妇科疾病累及到尿道或者是膀胱等。建议去医院进行尿常规的初步筛查，如果是由于炎症引起的，可以通过消炎治疗来减轻疼痛。