一般情况下，先天性食管狭窄原因如下：
1.主要原因是由于在胚胎发育过程中，食管形成时，过多的粘膜被吸收，空泡消失，只留下食管粘膜的局部或全部环形膜。此外，在食管的发育中，鳞状上皮替代了绒毛柱状上皮，从而导致了食管的过度增生。
2.在胚胎发育过程中，气管和食管隔膜的基底过度增生，造成食管先天狭窄。
3.有羊水过多的孕妇要注意有无先天性畸形。