吉尔伯特综合症的发病原因有：肝细胞的间接胆红素吸收障碍、肝细胞内的葡萄糖醛酸转移酶活力降低，以及与间接胆红素结合的白蛋白分离障碍等。精神打击、劳累、受凉、感染等是引起黄疸的主要原因。
一、主要原因
目前，这种疾病被认为是由以下几个原因引起食管粘的：
1.肝内胆红素葡萄糖醛酸基转移酶先天缺陷致肝细胞内的胆红素，血中结合胆红素升。但结合间接胆红素与葡萄糖醛酸结合障碍。肝内胆红素葡萄糖醛酸基转移酶先天性缺陷，会导致肝细胞内的胆红素排出困难，导致血液中不结合性胆红素水平升高。但无结合性（间接）胆红素与葡萄糖醛酸的结合没有障碍。
2.肝细胞吸收的胆红素的组织不正常，或者是胆红素进入肝细胞的结合点（颗粒）之前的运输过程会受到阻碍。
3.有人认为，肝脏的胆红素运输载体是Y和Z蛋白，这两种蛋白的缺失导致了肝脏的病理改。
二、诱发因素
疲劳，精神紧张，应激，感染，饮酒，感冒等是引起该病的主要原因。会导致肝负荷增加，肝细胞的合成能力降低，血液中接胆红素水平也会升高。当诱因被清除后，胆。