一般情况下，小肠结肠炎耶尔森菌肠炎可能是因为食用含有结肠耶尔森菌的食品，或是饮用受肠道耶尔森菌感染而导致的，多见于儿童、老年人、有免疫抑制和慢性病的患者。肠道耶尔森菌也可能是由粪便传染的。耶尔森菌寄生于猪群和牛群，它们对肠道传染病的扩散起着至关重要的作用。当细菌侵入到小肠时，会产生一种能加速水分和电解质的消化系统，导致腹泻，而侵入肠内的病菌也会破坏大肠，产生一种类似痢疾的粪便，带有血、脓和粘液。