一般情况下，人流后第三天肚子隐隐作痛可能是正常情况、宫腔积血等原因导致的。建议及时就医，查明病因，对症治疗。具体情况分析如下：
人工流产后第三天小肚子会隐隐作痛，如果是阵发性的，一般是由于子宫收缩引起的，人工流产后宫腔会出现少量出血，这时候宫颈口微张，宫腔积血可以通过阴道排出宫腔，但是如果子宫太大，子宫位置过前或者过度后弯，宫腔内出血难以排出，造成宫腔积血，这时候子宫就会出现宫腔积血，宫腔积血刺激子宫收缩，促进宫腔积血排出。