一般情况下，在月经期间如果不存在痛经的现象，这时候做肠镜不会有太大的影响。
女性的月经期做肠镜也没有不良影响。这是因为做肠镜是直接通过肛门进入肠道内检查，不会影响卵巢内分泌功能，也不会影响子宫内膜的脱落。但是如果女性在月经期间经常出现痛经的现象，并且痛经的情况比较严重，比如小腹疼痛剧烈，或者是腰部酸痛难忍等，这种情况做肠镜时，因为精神紧张可能会加重痛经的症状。