一般来说，月经只来了两天主要是以下情况。具体分析如下：
1.内分泌失调，当女性雄性激素含量高、雌激素含量比较低，可能出现月经只来了两天。
2.子宫内膜损伤，进行人流手术或者清宫手术，容易造成子宫内膜比较薄，可能出现月经只来了两天。
3.和怀孕有关系的疾病，宫外孕、先兆流产，也可以出现月经只来了两天。
需要注意的是，应当保持较为良好、健康的饮食和作息习惯，对身体有好处。