一般情况下，月经干净三天同房会不会怀孕，需要根据实际情况来判断。具体分析如下：
因为每个人的生理期和经期都不一样，月经干净三天同房，有可能会受孕，也有可能没有。月经周期30天的女性，在月经干净三天同房，这时不会出现卵子排出的情况，一般不会怀孕。但是，如果女性月经周期是21天，那么在月经干净三天同房，这时可能会有排卵，有很大的概率会怀孕。