一般情况下，吃避孕药后流褐色分泌物可能是突破性出血、子宫内膜撤退性出血等原因造成的，具体内容如下：
口服短效避孕药时出现褐色的分泌物，有很大的可能性是因为口服了避孕药摄入大量激素，子宫内膜会被刺激，从而发生破裂。如果使用了短期避孕药，停药后出现了阴道褐色的分泌物，可能是因为子宫内膜撤退性出血，所以可以认为是一次月经。紧急避孕药物会出现阴道褐色色的分泌物。如果是激素过量所造成的子宫内膜剥落，这种情况下不需要特别治疗。