通常情况下，吃了紧急避孕药肚子疼可能是胃肠道刺激、避孕药副作用等导致的。具体情况分析如下：
紧急避孕药的这个副作用通常不会持续24个小时。在服用了紧急避孕药之后，应该在两个小时内不要吃东西。建议可以在晚上睡觉之前使用紧急避孕药，这样可以减轻避孕药对胃肠道的刺激。因为紧急避孕药的副作用很大，一年内最多只能吃三次，每次三次都要间隔在三个月以上。