一般来说，药流后不干净应当通过以下方式治疗。具体分析如下：
药流后不干净，残余的子宫会造成阴道持续出血、大出血、钙化、粘连、感染、继发不孕等。这种情况下，患者需要在医生的指导下做好清宫手术，并可以服用头孢类、左氧氟沙星等抗生素来防止感染。
需要注意的是，生活中建议适当食用富含维生素的食物，如新鲜的水果、蔬菜等。