一般情况下，三个半月儿童房缺损是否可以打疫苗，需要根据实际情况来判断。具体分析如下：
当三个半月儿童的房间隔缺损很小，没有呼吸困难、口唇青紫、没有进食困难等问题的时候，以打疫苗。如果三个半月儿出现呼吸困难、口唇青紫、生长发育不良等情况时，应停止接种，这种情况下不可以打疫苗，做心脏导管封堵手术后，再打疫苗。