一般情况下，宝宝大便化验有霉菌可以采用以下方式进行治疗：
如果受到霉菌感染、肚子受寒、肠道炎症等都会导致宝宝大便化验有霉菌。如果宝宝的病情不是很重，可以口服蒙脱石散，起到一定的预防和治疗的效果。另外，还可以口服一些益生菌类的药物，比如服用双歧四联活菌颗粒，可以调整肠胃的微生态，促进细菌的生长，能够缓解症状。平时注意宝宝的饮食卫生。