十二岁男孩消化不良，如果是因为饮食方面的原因，比如暴饮暴食等，可以口服健胃消食片、大山楂丸等，日常生活中要多喝水，多吃一些水果和蔬菜，同时还要多吃一些有益于消化的益生菌。
也有可能是因为心情不稳定，睡眠不足，烟酒刺激等原因引起的，这时候要对症治疗，要调整好心情，多休息。也有可能是因为某种器官病变导致的消化不良，此时要积极就医。