三个月小孩发烧可以通过物理治疗、多喝水、药物治疗等方式进行治疗，具体分析如下：
三个月小孩发烧，要根据孩子的体温来判断，如果体温超过38.6℃，可以用药物进行治疗，因为此时孩子的抵抗力和免疫力都比较差，所以要及时的进行治疗，避免孩子继续发烧，导致肺炎。38.6℃以下的时候可以进行物理降温，用温水擦拭宝宝腋窝、手脚、颈部等部位。多给孩子喝水，这样可以补充流失的水分。