一般来说，二岁小孩发烧39℃应当采取以下措施。具体分析如下：
1、二岁小孩发烧39℃，应当立即服用布洛芬、对乙酰氨基酚等药物进行退热；
2、二岁小孩发烧39℃，可以进行物理降温，可以通过敷热贴或者热水擦浴或者是热水澡来进行身体的物理冷却；
3、二岁小孩发烧39℃，建议去医院的儿科急诊室做血液c反应蛋白检查，以确定是否有感染情况。
需要注意的是，家长应当保持室内空气新鲜及良好的通风，但是要避免冷风冷气直接吹袭。