对于手足口病ev71型病毒感染，需要进行抗病毒治疗和对症治疗。在西医中，利巴韦林、奥司他韦等是临床上常用的药物。
治疗手足口病的药物主要有中药和中成药，常用的药物有大青叶和金银花。常用的中成药有蓝芩口服液、抗病毒口服液。如果病人有38.5℃以上的高烧，可以使用布洛芬退热。
如果口腔有明显的疼痛症状，可以口服一些口腔炎症的喷雾剂来缓解。通常一星期后就会好。在生病的时候要多饮水，保持肌肤的干燥和干净。