一般情况下，宝宝打完防疫针后半夜哭闹可能是以下情况造成的：
1、受了惊吓，5-6岁的孩子会感到害怕，打了预防针会导致孩子受到惊吓；
2、是注射位置的痛楚；上述两种理由最为普遍。
3、是打一些疫苗会引起宝宝出现头痛、鼻塞等情况，引起宝宝在夜间啼哭。另外，在注射了疫苗以后，孩子的胃口会变差，晚上会饥饿也是一个重要的因素。