一般情况下，宝宝发烧眼睛有眼屎可在医生指导下使用药物进行改善，具体内容如下：
上呼吸道感染、结膜炎、咽结膜热等都会导致孩子发热，眼睛里有眼屎。可以用消毒的棉花沾上消毒的生理盐水，每日清洗眼睛里的多余的东西。可以选用金霉素眼膏、妥布霉素眼液、利福平眼液等抗炎眼膏。可以去医院就诊，可以用生理盐水清洗眼睛。可以口服小柴胡冲剂、柴桂解毒口服液等。当宝宝的身体温度高于38.5摄氏度时，可以服用百服宁、美林、泰诺林。可以口服一些抗菌的药物，例如头孢呋辛、阿莫西林等。