一般情况下，儿童恒牙萌出囊肿治疗方法是手术治疗。具体情况分析如下：
小儿恒牙萌出囊肿的症状是在口腔粘膜表面形成半透明、富有弹性的软组织包块。一般是生长缓慢，初期无明显的症状，无法自行愈合时，要做全口曲面断层片，以确定囊肿的大小和与周边组织的关系。对于体积较小的囊肿，可以采用局部麻醉，消毒后切开，囊内液体流出后，囊肿会慢慢消失。体积大、反复增生的囊肿，必须在局部麻醉下将囊壁和周边的软组织一起切除，同时要保持口腔的卫生，避免辛辣刺激。