一般来说，儿童肠道淋巴结肿大主要是因为病毒和病菌侵入身体引起的。可以在医生指导下使用抗炎、抗病毒的头孢类的抗病毒药物，如利巴韦林颗粒、头孢氨苄颗粒等。日常生活中要多给孩子多摄入一些新鲜的水果和蔬菜，以保证大便畅通，有助于排除淋巴结肿大。还可以结合一些中成药或者是清热解毒的药来治疗，可以在医生指导下使用一些治疗淋巴结肿大的中药，比如：银翘解毒颗粒、双黄连口服液、银翘解毒颗粒、双黄连口服液等，都可以起到很好的控制淋巴结肿大的作用。
此外，应该保证宝宝清淡饮食，有助于改善儿童肠道淋巴结肿大的不适症状。