细菌和分泌物积存在扁桃体窝会引起孕妇扁桃体发炎，常见的细菌有链球菌和葡萄球菌。其次是其它急性传染病如麻疹、白喉、流感、猩红热等。
此外，扁桃体发炎与妊娠后机体的免疫功能有关。从中医的观点来看，女性在怀孕后会有阴虚火旺的表现，比如口干咽燥，这也是导致细菌病毒入侵的主要因素。孕妇要多饮水，多吃一些新鲜的蔬菜和水果，这样可以防止细菌病毒侵入口腔粘膜。