怀孕初期可以通过药物治疗的方式治疗霉菌感染，具体分析如下：
霉菌感染是一种比较顽固的疾病，因为现在是孕早期，胎儿发育的关键时期，只能外用药物治疗配合栓剂，如康复炎栓、康复炎栓、苦参洗液等都是比较好的。一种药不能连续使用超过一周，不能口服，因为口服药不仅副作用大，还会影响胎儿的发育。可以考虑用中药熬水熏洗，也可以找专业的中医来治疗。