一般情况下，怀孕40天肚子疼、腰疼可能会有湿疣或者是妇科炎症等病症导致的，但如果患者伴出现阴道出血的情况，可能会导致流产、异位妊娠等，因此孕妇需要到妇产科做一下子宫超声波，通过血液孕酮检测确定是否存在此病症，然后进行相应的治疗，日常生活中要多休息，不要做激烈的运动，不要对孕妇的肚子产生撞击、挤压等刺激，以免加重。