一般情况下，胎儿肾囊不会消失。具体分析如下：
胎儿肾囊肿分单纯性肾囊肿和多囊肾两种情况。多囊肾是属于遗传性的疾病，需要进一步检查胎儿是否还伴有其他畸形。胎儿的肾囊肿还可能是输尿管发育不良引起的，这种情况分娩以后可以通过手术治疗。如果出现不适症状，需要及时到医院检查，然后在医生的指导下进行相应的治疗。