一般情况下，怀孕40天肚子隐隐疼可能是生理性因素造成的，也可能是病理性因素造成的，女性应对症进行处理，具体内容如下：
1.生理性因素：如果女性在怀孕后出现精神压力过重、过度疲劳等情况，可能会在生理性因素的影响下出现肚子隐隐疼的情况。此时，女性应注意休息，要保持心情愉悦，避免过度运动。
2.病理性因素：如果女性患有异位妊娠、子宫肌瘤等病症，在疾病的影响下，女性也可能感觉肚子隐隐疼。此时，女性应及时到医院就诊，明确病因后对症进行治疗。