一般情况下，怀孕初期阴道有褐色分泌物可能是先兆流产、异位妊娠等因素造成的，具体内容如下：
1.先兆流产：情绪激动、体质较差等因素可能导致女性出现先兆流产，多有腹痛、阴道流血等不适症状，可能出现怀孕初期阴道有褐色分泌物的情况。女性应及时就诊，必要时要遵医嘱使用黄体酮胶囊、地屈孕酮片等药物进行保胎治疗。
2.异位妊娠：输卵管炎症、受精卵游走等因素可能导致女性出现异位妊娠，也可能使女性腹痛、阴道出血，可能导致女性发现怀孕初期阴道有褐色分泌物。女性应及时就医，必要时需要行输卵管开窗术、输卵管切除术等进行治疗。