一般来说，怀孕两个月肚子疼腰酸主要是以下原因。具体分析如下：
怀孕两个月肚子疼腰酸，考虑这是一种正常的早孕反应，主要是怀孕后受到体内的激素分泌引起的的变化，若无其他不适症状，一般是正常的生理现象，无需特殊治疗，适当休息有助于缓解相关症状。此外，也有可能这是由于怀孕之后，子宫逐渐增大，从而对局部的肌肉组织造成一定压迫而引起的表现，可以适当的采用侧卧位，或者用毛巾热敷来帮助缓解不适症状。
需要注意的是，怀孕期间建议合理膳食，尽量以清淡为主，少吃辛辣刺激性食物。